ImageJ est un logiciel libre multiplateforme d’analyse et de traitement d’images, inspiré à l’origine du logiciel NIH Image pour Macintosh. Un certain nombre de traitements d'images basiques sont disponibles par défaut : seuillage, convolutions, morphologie mathématique, comptage d'objets... Beaucoup d'autres fonctionnalités sont disponibles sur le web sous forme de plugins ou de macro.
