Jmol est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Java et est multi-plateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix.Le logiciel est disponible sous trois formes :
Une application indépendante
Un kit logiciel pour intégrer Jmol dans d'autres applications Java
Une applet Java qui peut être intégrée au sein de page Web et qui offre de nombreuses possibilités de visualiser des molécules
Le logiciel Jmol supporte de nombreux modes de visualisation :